Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Smpd1Q04519 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smpd1Q04519 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms