Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Crisp3Q03402 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms