Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl7Q03366 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl7Q03366 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms