Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Runx1Q03347 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Runx1Q03347 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms