Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ddr1Q03146 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddr1Q03146 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms