Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Mmp11Q02853 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mmp11Q02853 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mmp11Q02853 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mmp11Q02853 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mmp11Q02853 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mmp11Q02853 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mmp11Q02853 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mmp11Q02853 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mmp11Q02853 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mmp11Q02853 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Mmp11Q02853 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Mmp11Q02853 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mmp11Q02853 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mmp11Q02853 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mmp11Q02853 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mmp11Q02853 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mmp11Q02853 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mmp11Q02853 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mmp11Q02853 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mmp11Q02853 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mmp11Q02853 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mmp11Q02853 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mmp11Q02853 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mmp11Q02853 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mmp11Q02853 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mmp11Q02853 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mmp11Q02853 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mmp11Q02853 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mmp11Q02853 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mmp11Q02853 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms