Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NfiaQ02780 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms