Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjb4Q02738 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjb4Q02738 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms