Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ascl1Q02067 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ascl1Q02067 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms