Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ly9Q01965 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ly9Q01965 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ly9Q01965 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ly9Q01965 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ly9Q01965 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ly9Q01965 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ly9Q01965 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ly9Q01965 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ly9Q01965 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ly9Q01965 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ly9Q01965 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ly9Q01965 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ly9Q01965 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly9Q01965 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms