Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nme2Q01768 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms