Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EgfrQ01279 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EgfrQ01279 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms