Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HmgcrQ01237 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms