Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col1a2Q01149 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Col1a2Q01149 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms