Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp4Q00724 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms