Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pax8Q00288 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax8Q00288 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms