Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rbbp6P97868 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rbbp6P97868 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms