Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nbr1P97432 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms