Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atp1b3P97370 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atp1b3P97370 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1b3P97370 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1b3P97370 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1b3P97370 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1b3P97370 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1b3P97370 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atp1b3P97370 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms