Protein–RNA interactions for Protein: P97360

Etv6, Transcription factor ETV6, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv6P97360 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Etv6P97360 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Etv6P97360 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Etv6P97360 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Etv6P97360 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Etv6P97360 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Etv6P97360 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Etv6P97360 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Etv6P97360 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Etv6P97360 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Etv6P97360 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Etv6P97360 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Etv6P97360 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Etv6P97360 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Etv6P97360 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Etv6P97360 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Etv6P97360 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Etv6P97360 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Etv6P97360 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Etv6P97360 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Etv6P97360 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Etv6P97360 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Etv6P97360 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Etv6P97360 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Etv6P97360 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Etv6P97360 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Etv6P97360 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Etv6P97360 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Etv6P97360 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Etv6P97360 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Etv6P97360 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Etv6P97360 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Etv6P97360 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Etv6P97360 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Etv6P97360 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Etv6P97360 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Etv6P97360 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Etv6P97360 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Etv6P97360 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Etv6P97360 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Etv6P97360 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Etv6P97360 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Etv6P97360 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Etv6P97360 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Etv6P97360 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Etv6P97360 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Etv6P97360 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Etv6P97360 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Etv6P97360 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Etv6P97360 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Etv6P97360 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Etv6P97360 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Etv6P97360 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Etv6P97360 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Etv6P97360 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Etv6P97360 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Etv6P97360 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Etv6P97360 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Etv6P97360 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Etv6P97360 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Etv6P97360 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Etv6P97360 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Etv6P97360 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Etv6P97360 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Etv6P97360 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Etv6P97360 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Etv6P97360 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Etv6P97360 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Etv6P97360 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Etv6P97360 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Etv6P97360 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Etv6P97360 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Etv6P97360 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Etv6P97360 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Etv6P97360 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Etv6P97360 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Etv6P97360 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Etv6P97360 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Etv6P97360 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Etv6P97360 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Etv6P97360 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Etv6P97360 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Etv6P97360 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Etv6P97360 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Etv6P97360 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Etv6P97360 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Etv6P97360 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms