Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arf1P84078 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arf1P84078 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arf1P84078 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf1P84078 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf1P84078 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf1P84078 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf1P84078 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf1P84078 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf1P84078 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf1P84078 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf1P84078 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf1P84078 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf1P84078 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf1P84078 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf1P84078 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf1P84078 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf1P84078 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arf1P84078 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arf1P84078 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arf1P84078 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arf1P84078 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arf1P84078 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
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Arf1P84078 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arf1P84078 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arf1P84078 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arf1P84078 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms