Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TgfbiP82198 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TgfbiP82198 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms