Protein–RNA interactions for Protein: P80313

Cct7, T-complex protein 1 subunit eta, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct7P80313 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cct7P80313 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cct7P80313 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cct7P80313 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cct7P80313 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cct7P80313 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cct7P80313 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cct7P80313 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cct7P80313 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cct7P80313 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cct7P80313 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cct7P80313 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cct7P80313 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cct7P80313 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cct7P80313 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cct7P80313 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cct7P80313 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cct7P80313 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cct7P80313 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cct7P80313 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cct7P80313 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cct7P80313 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cct7P80313 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cct7P80313 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cct7P80313 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cct7P80313 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms