Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx1P80205 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx1P80205 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx1P80205 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx1P80205 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx1P80205 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx1P80205 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otx1P80205 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otx1P80205 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otx1P80205 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otx1P80205 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms