Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf11P70378 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf11P70378 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf11P70378 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf11P70378 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf11P70378 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf11P70378 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf11P70378 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf11P70378 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf11P70378 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fgf11P70378 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgf11P70378 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgf11P70378 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgf11P70378 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgf11P70378 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgf11P70378 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgf11P70378 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgf11P70378 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgf11P70378 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgf11P70378 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgf11P70378 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgf11P70378 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fgf11P70378 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fgf11P70378 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms