Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd13P70217 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxd13P70217 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd13P70217 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms