Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plxna3P70208 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plxna3P70208 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plxna3P70208 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plxna3P70208 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plxna3P70208 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plxna3P70208 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Plxna3P70208 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plxna3P70208 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plxna3P70208 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plxna3P70208 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plxna3P70208 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plxna3P70208 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Plxna3P70208 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plxna3P70208 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plxna3P70208 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plxna3P70208 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Plxna3P70208 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plxna3P70208 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plxna3P70208 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plxna3P70208 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plxna3P70208 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Plxna3P70208 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plxna3P70208 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Plxna3P70208 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Plxna3P70208 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Plxna3P70208 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plxna3P70208 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plxna3P70208 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plxna3P70208 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plxna3P70208 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plxna3P70208 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plxna3P70208 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plxna3P70208 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plxna3P70208 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plxna3P70208 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plxna3P70208 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plxna3P70208 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plxna3P70208 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms