Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lrig1P70193 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrig1P70193 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms