Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC39.76■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC39.76■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC39.76■■■■□ 3.95
Abcc9P70170 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
Abcc9P70170 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
Abcc9P70170 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC39.75■■■■□ 3.95
Abcc9P70170 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Abcc9P70170 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Abcc9P70170 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Abcc9P70170 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Abcc9P70170 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Abcc9P70170 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Abcc9P70170 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
Abcc9P70170 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Abcc9P70170 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
Abcc9P70170 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
Abcc9P70170 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
Abcc9P70170 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
Abcc9P70170 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Abcc9P70170 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Abcc9P70170 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Abcc9P70170 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Abcc9P70170 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Abcc9P70170 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Abcc9P70170 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Abcc9P70170 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Abcc9P70170 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Abcc9P70170 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Abcc9P70170 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Abcc9P70170 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Abcc9P70170 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Abcc9P70170 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Abcc9P70170 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Abcc9P70170 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Abcc9P70170 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
Abcc9P70170 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Abcc9P70170 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Abcc9P70170 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Abcc9P70170 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Abcc9P70170 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
Abcc9P70170 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
Abcc9P70170 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Abcc9P70170 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Abcc9P70170 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Abcc9P70170 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Abcc9P70170 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.94
Abcc9P70170 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Abcc9P70170 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Abcc9P70170 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Abcc9P70170 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Abcc9P70170 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Abcc9P70170 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
Abcc9P70170 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Abcc9P70170 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC39.63■■■■□ 3.93
Abcc9P70170 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
Abcc9P70170 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Abcc9P70170 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
Abcc9P70170 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
Abcc9P70170 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
Abcc9P70170 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Abcc9P70170 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
Abcc9P70170 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Abcc9P70170 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Abcc9P70170 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Abcc9P70170 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC39.61■■■■□ 3.93
Abcc9P70170 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Abcc9P70170 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms