Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubb4bP68372 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubb4bP68372 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms