Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SnrpnP63163 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SnrpnP63163 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnrpnP63163 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnrpnP63163 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnrpnP63163 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SnrpnP63163 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms