Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl30P62889 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl30P62889 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms