Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsm5P62322 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lsm5P62322 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms