Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps13P62301 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rps13P62301 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps13P62301 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps13P62301 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps13P62301 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps13P62301 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms