Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps11P62281 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps11P62281 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rps11P62281 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps11P62281 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps11P62281 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps11P62281 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps11P62281 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps11P62281 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps11P62281 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps11P62281 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps11P62281 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps11P62281 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rps11P62281 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms