Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Lmo4P61969 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms