Protein–RNA interactions for Protein: P60191

Rims4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims4P60191 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rims4P60191 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rims4P60191 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rims4P60191 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rims4P60191 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rims4P60191 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rims4P60191 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rims4P60191 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rims4P60191 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rims4P60191 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rims4P60191 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rims4P60191 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rims4P60191 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rims4P60191 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rims4P60191 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rims4P60191 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rims4P60191 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rims4P60191 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rims4P60191 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rims4P60191 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rims4P60191 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rims4P60191 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rims4P60191 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rims4P60191 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rims4P60191 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rims4P60191 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rims4P60191 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rims4P60191 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rims4P60191 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rims4P60191 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rims4P60191 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims4P60191 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims4P60191 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims4P60191 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims4P60191 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims4P60191 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rims4P60191 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rims4P60191 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rims4P60191 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims4P60191 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims4P60191 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims4P60191 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rims4P60191 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rims4P60191 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rims4P60191 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms