Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nphp4P59240 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms