Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nup43P59235 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup43P59235 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup43P59235 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup43P59235 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup43P59235 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup43P59235 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup43P59235 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup43P59235 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup43P59235 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup43P59235 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup43P59235 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup43P59235 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup43P59235 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup43P59235 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup43P59235 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup43P59235 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup43P59235 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nup43P59235 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup43P59235 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup43P59235 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup43P59235 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup43P59235 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nup43P59235 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup43P59235 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup43P59235 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup43P59235 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup43P59235 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup43P59235 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nup43P59235 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup43P59235 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup43P59235 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup43P59235 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms