Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Csrnp1P59054 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Csrnp1P59054 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csrnp1P59054 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Csrnp1P59054 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms