Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Setd4P58467 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Setd4P58467 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Setd4P58467 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Setd4P58467 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Setd4P58467 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Setd4P58467 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setd4P58467 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Setd4P58467 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd4P58467 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd4P58467 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd4P58467 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Setd4P58467 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms