Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snrpa1P57784 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snrpa1P57784 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms