Protein–RNA interactions for Protein: P57722

Pcbp3, Poly(rC)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp3P57722 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcbp3P57722 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcbp3P57722 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pcbp3P57722 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pcbp3P57722 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcbp3P57722 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pcbp3P57722 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pcbp3P57722 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pcbp3P57722 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcbp3P57722 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcbp3P57722 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcbp3P57722 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcbp3P57722 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcbp3P57722 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcbp3P57722 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcbp3P57722 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcbp3P57722 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcbp3P57722 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcbp3P57722 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcbp3P57722 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcbp3P57722 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcbp3P57722 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcbp3P57722 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcbp3P57722 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcbp3P57722 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms