Protein–RNA interactions for Protein: P56960

Exosc10, Exosome component 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc10P56960 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Exosc10P56960 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Exosc10P56960 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms