Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bace1P56818 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bace1P56818 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bace1P56818 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bace1P56818 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bace1P56818 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bace1P56818 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bace1P56818 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bace1P56818 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bace1P56818 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bace1P56818 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bace1P56818 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Bace1P56818 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bace1P56818 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bace1P56818 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bace1P56818 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bace1P56818 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms