Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lim2P56563 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lim2P56563 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lim2P56563 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lim2P56563 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lim2P56563 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lim2P56563 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lim2P56563 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lim2P56563 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lim2P56563 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lim2P56563 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms