Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CckbrP56481 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CckbrP56481 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CckbrP56481 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CckbrP56481 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CckbrP56481 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CckbrP56481 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CckbrP56481 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CckbrP56481 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CckbrP56481 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CckbrP56481 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CckbrP56481 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms