Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ephb3P54754 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ephb3P54754 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms