Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Fdft1P53798 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fdft1P53798 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fdft1P53798 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fdft1P53798 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fdft1P53798 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fdft1P53798 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fdft1P53798 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fdft1P53798 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fdft1P53798 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fdft1P53798 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fdft1P53798 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fdft1P53798 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fdft1P53798 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fdft1P53798 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fdft1P53798 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fdft1P53798 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fdft1P53798 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fdft1P53798 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fdft1P53798 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fdft1P53798 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Fdft1P53798 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fdft1P53798 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fdft1P53798 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fdft1P53798 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fdft1P53798 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fdft1P53798 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fdft1P53798 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms