Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Upp1P52624 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Upp1P52624 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Upp1P52624 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Upp1P52624 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Upp1P52624 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Upp1P52624 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Upp1P52624 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Upp1P52624 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Upp1P52624 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Upp1P52624 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Upp1P52624 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Upp1P52624 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Upp1P52624 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Upp1P52624 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Upp1P52624 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Upp1P52624 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Upp1P52624 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms